Для того, что бы все было гарантированно нормально нужно поставить правильный расчет итогов. Вот смотрите. Я ставлю первый квартал через Сервис-Параметры.

А моя проводка проведена августом.

Внизу я вывел начало и конец периода по которому указан итог. Об этом я расскажу немного дальше. Как видите, операция не отражена в итогах. Поменяю период на 4 квартал.
И теперь проводка отражена в отчетности.

Так вот проводка может быть не отражена в состоянии счетов, если не попадает в установленный период.